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擎科生物開發(fā)超長片段快速基因合成技術(shù)

2022-04-09 14:30 美通社

導(dǎo)讀:北京2022年4月8日 -- 超長片段快速基因合成技術(shù)是目前基因合成領(lǐng)域技術(shù)開發(fā)的重難點之一。作為大片段基因合成與精準測序公共服務(wù)平臺,近期,擎科生物開發(fā)的超長片段快速基因合成技術(shù),成功突破酵母組裝多片段、大片段的核心技術(shù),可工業(yè)化生產(chǎn)50Kb大片段DNA,最長合成長度可達160Kb。

北京2022年4月8日 -- 超長片段快速基因合成技術(shù)是目前基因合成領(lǐng)域技術(shù)開發(fā)的重難點之一。作為大片段基因合成與精準測序公共服務(wù)平臺,近期,擎科生物開發(fā)的超長片段快速基因合成技術(shù),成功突破酵母組裝多片段、大片段的核心技術(shù),可工業(yè)化生產(chǎn)50Kb大片段DNA,最長合成長度可達160Kb。

大片段DNA的工業(yè)化生產(chǎn)是合成生物學(xué)發(fā)展應(yīng)用過程中的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。發(fā)展DNA大片段和染色體的高保真合成和組裝技術(shù),首先是通過PCR反應(yīng)合成短片斷,其長度往往小于1kb。將多個1kb的小片段組裝為一個大片段DNA分子,目前最常用的組裝技術(shù)是Gibson重組。

Gibson組裝技術(shù)在2009年首次被Dr.Daniel和其同事提出,因能輕易地組裝多個線性DNA片段而著名,也可以用于將一個目的片段插入選擇的載體中完成基本克隆。進行Gibson連接時首先需要獲得末端含有同源區(qū)域的DNA片段,一般是通過PCR獲得,然后這些片段和酶混合物(an enzyme master mix)共孵育完成連接。

擎科生物的超長片段快速基因合成技術(shù),同時采用Gibson重組與酵母平臺進行大片段組裝。其中酵母組裝平臺參考酵母細胞內(nèi)部的同源重組機制,構(gòu)建酵母人工合成染色體(YACs)。一些研究表明,酵母細胞可以攝入多個DNA片段,可裝配四或者五個重疊的DNA片段連接到載體DNA上[1] 。但 是 現(xiàn) 有 的 酵 母 重 組 技 術(shù) 都要逐個挑取酵母單菌落培養(yǎng)篩選,線性化酵母載體要經(jīng)過PCR獲得[2],整體時間會相應(yīng)的延長、保真度會下降、操作的復(fù)雜性和工作量都會增加。因此如何能夠低成本,快速高通量篩選正確克隆成為酵母組裝大片段DNA分子方法的關(guān)鍵技術(shù)。

擎科生物使用的超長片段快速合成技術(shù),可將多個小片段DNA分子組裝成一個大片段DNA分子。速度快、簡便可行、成功率高、成本低,效率高、易操作,可進行工業(yè)化規(guī)模擴大,用途廣泛。不僅能夠幫助研究者對物種進行基因優(yōu)化,提高基因表達,還可以合成已知序列的難擴增基因以及大量用于微芯片的cDNA;甚至是幫助醫(yī)療研究設(shè)計合成基因疫苗、基因治療載體。尤其對于基礎(chǔ)研究方面,可加強對基因的結(jié)構(gòu)功能研究,修改設(shè)計基因,在育種方面也可以利用這一技術(shù)合成不同的基因突變株、SNPS、或其它突變株。

在實際操作上,擎科生物還進行了一系列優(yōu)化,最終開發(fā)出的超長片段快速基因合成技術(shù)生產(chǎn)片段長度可達160Kb,保障能夠在最短時間為客戶提供高品質(zhì)基因合成服務(wù)。經(jīng)過長期驗證,這確實是一種有效的長片段 DNA 合成方法。

同時,為保證合成片段的準確性,服務(wù)過程還包括序列優(yōu)化、引物設(shè)計、小片段合成、大片段重組等多個流程,還包括大片段組裝前后的兩次測序驗證。用二代測序技術(shù)對大片段進行測序驗證,以精準的基因檢測技術(shù)保證合成產(chǎn)物的100%準確性。與此同時,擎科生物在全國各地建立了21家分/子公司,以強大的服務(wù)網(wǎng)絡(luò)體系和物流系統(tǒng)快捷響應(yīng)客戶需求。

參考文獻:

[1]R a y m o n d ,C . K . e t . a l . B i o t e c h n i q u e s ( 1 9 9 9 ) 2 6 : 1 3 4 ‐ 1 3 8

[2]Gibson,D G .et .al .Science(2008)5867:1215‐1220

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